生物安全柜的通風系統是保證其正常工作的關鍵部分，其作用是通過通風系統將空氣從實驗室內部排出，并將新鮮空氣帶入實驗室，以確保實驗室內部空氣的流通和更新。生物安全柜的通風系統一般由排風系統、送風系統和過濾系統組成。
排風系統通常由風機、排氣管道和排氣口組成，其作用是將實驗室內的污染氣體和粉塵顆粒排出室外。送風系統則通常由送風管道和送風口組成，其作用是將新鮮空氣送入實驗室。過濾系統則是通過安裝高效過濾器，過濾掉空氣中的細菌、病毒等微生物，保障實驗室操作的安全。
在維護生物安全柜的通風系統時，需要注意以下幾點：
定期檢查排風系統和送風系統的風機、管道、口徑和連接件是否存在磨損、老化、松動等現象，如發現問題應及時更換或修理。
定期檢查過濾系統的過濾器是否需要更換，一般建議每6個月更換一次，如發現過濾器已經失效或其效率不足，則應及時更換。
定期檢查通風系統的風速是否符合標準，以確保通風效果和安全性。
定期清洗通風系統的風道、風機等部件，以確保其暢通無阻。
在使用過程中應定期對通風系統進行漏氣測試，確保通風系統不存在漏氣現象。